El equipo de Ubuntu ha lanzado un sitio de apoyo llamado Ubuntu Brainstorm.

Estas son las ideas que más me llaman la atención (en orden de preferencia):

#35 - Start taking advantage of Upstart: Ubuntu, si bien utiliza upstart como remplazo a init, no le saca provecho. He hecho algunas pruebas y es posible mejorar el rendimiento sorprendentemente si se configura correctamente.
#42 - Speed Up Ubuntu-Gnome boot time: parecido al anterior. Federico Mena tiene un especial interés en el tema.
#169 - SVN Integration with Nautilus: Tal vez no es muy demandado por los usuarios común, pero se me ocurren pocas características mejores para desarrolladores.
#4 - Provide a simple graphical interface to manage _any_ type of network connection: NetworkManager es excelente, pero todavía no logra ser suficientemente maduro.
#8 - Bittorrent for apt: Bajar packages a través de torrent parece una buena idea, especialmente para los días en que hay demasiada demanda (releases), pero ¿tendría que correr un proceso background para ser seed?
#32 - Debian Regocnition Day: Un homenaje a Debian
#194 - Easy mounting of Images like ISO and CUE: Gran funcionalidad por sólo algunas líneas de código
#72 - Unmount Resolution: ídem